Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLEC4DQ8WXI8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLEC4DQ8WXI8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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