Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms