Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms