Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms