Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms