Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE22Q8NFJ8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms