Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms