Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CASC2Q6XLA1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms