Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4L3Q6VB84 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms