Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMBR1LQ6UX01 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms