Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDGFL1Q5TGJ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms