Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZIK1Q3SY52 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms