Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TNXAQ16473 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNXAQ16473 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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