Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSHL1Q14406 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSHL1Q14406 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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