Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RIGQ13278 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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