Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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