Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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PTP4A2Q12974 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PTP4A2Q12974 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTP4A2Q12974 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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