Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 TXNRD2-207ENST00000462843 810 ntTSL 314.36□□□□□ -0.119e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TXNRD2-219ENST00000634471 748 ntTSL 314.36□□□□□ -0.119e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-212ENST00000547800 825 ntTSL 214.33□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EFEMP2-214ENST00000530850 566 ntTSL 414.3□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-230ENST00000412274 496 ntTSL 214.29□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 KLC2-208ENST00000440228 620 ntTSL 414.26□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 KLC2-213ENST00000531240 559 ntTSL 414.24□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NEU4-210ENST00000428592 505 ntTSL 414.21□□□□□ -0.132e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDX19A-213ENST00000569319 1643 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PKP4-214ENST00000492496 796 ntTSL 314.16□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ASL-206ENST00000464970 640 ntTSL 314.15□□□□□ -0.144e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 SKIV2L-202ENST00000461073 1157 ntTSL 214.13□□□□□ -0.159e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MVK-215ENST00000636529 1509 ntTSL 514.13□□□□□ -0.159e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PLD2-203ENST00000572127 632 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-212ENST00000488327 541 ntTSL 414.08□□□□□ -0.161e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.161e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-220ENST00000529116 555 ntTSL 414.08□□□□□ -0.161e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 LYSMD4-206ENST00000479791 3001 ntTSL 514.07□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-250ENST00000503628 570 ntTSL 414.05□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.171e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.179e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TIA1-219ENST00000496452 853 ntTSL 213.94□□□□□ -0.189e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PSMA7-204ENST00000442551 685 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 KLC2-212ENST00000526758 594 ntTSL 413.91□□□□□ -0.189e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-229ENST00000396342 675 ntTSL 313.9□□□□□ -0.189e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-256ENST00000505066 556 ntTSL 413.9□□□□□ -0.189e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 C14orf80-208ENST00000427614 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.87□□□□□ -0.199e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.199e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.199e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-223ENST00000533762 722 ntTSL 513.83□□□□□ -0.21e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-268ENST00000512694 623 ntTSL 413.81□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NEU4-209ENST00000426032 676 ntTSL 313.79□□□□□ -0.22e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.219e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ENKD1-203ENST00000602415 735 ntTSL 313.74□□□□□ -0.219e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.219e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 THOP1-212ENST00000591149 789 ntTSL 313.67□□□□□ -0.228e-34■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 IRF3-211ENST00000596644 550 ntTSL 213.64□□□□□ -0.239e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PLD2-209ENST00000575246 2278 ntTSL 213.61□□□□□ -0.231e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-219ENST00000528624 562 ntTSL 413.6□□□□□ -0.231e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 THOP1-207ENST00000587401 702 ntTSL 213.59□□□□□ -0.231e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.234e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CERS5-220ENST00000550258 579 ntTSL 413.52□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 COBL-208ENST00000452534 1842 ntTSL 513.51□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MINK1-206ENST00000572304 559 ntTSL 413.49□□□□□ -0.251e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GNL3-203ENST00000460073 583 ntTSL 413.48□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 EFEMP2-209ENST00000527969 1562 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.269e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.269e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GRHPR-208ENST00000493368 1136 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.261e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MTFR1L-216ENST00000525713 575 ntTSL 413.35□□□□□ -0.271e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.289e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSTA3-209ENST00000529048 869 ntTSL 513.33□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TSTA3-206ENST00000527549 575 ntTSL 213.33□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GUK1-217ENST00000465025 783 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-12■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.289e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GTF2F1-203ENST00000594213 1002 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ST3GAL3-226ENST00000490502 592 ntTSL 313.19□□□□□ -0.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 POM121C-203ENST00000473168 549 ntTSL 413.16□□□□□ -0.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.39e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-253ENST00000504651 571 ntTSL 313.13□□□□□ -0.319e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 C3-205ENST00000595577 714 ntTSL 213.11□□□□□ -0.319e-13■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.319e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-206ENST00000561534 714 ntTSL 513.08□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-216ENST00000566815 929 ntTSL 513.08□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.339e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GRHPR-206ENST00000487399 952 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-9■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.339e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-213ENST00000566522 592 ntTSL 512.98□□□□□ -0.339e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 512.93□□□□□ -0.349e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ANGPTL8-202ENST00000587543 432 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 AL928654.4-201ENST00000477724 678 ntAPPRIS P5 TSL 412.87□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.85□□□□□ -0.359e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 DDR1-237ENST00000437124 587 ntTSL 412.8□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 IPO4-210ENST00000559635 492 ntTSL 312.77□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 CHMP4A-203ENST00000527154 571 ntTSL 212.76□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 ENKD1-205ENST00000602642 468 ntTSL 212.75□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 TMEM98-208ENST00000583120 504 ntTSL 212.71□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 24.7
SF3A3Q12874 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.389e-7■■■■□ 24.7
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