Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD300CQ08708 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms