Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TNP2Q05952 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms