Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F1Q01094 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms