Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGD1P98174 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD1P98174 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms