Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms