Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RND2P52198 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RND2P52198 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RND2P52198 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RND2P52198 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms