Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK4P51957 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEK4P51957 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEK4P51957 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEK4P51957 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms