Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NMUP48645 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NMUP48645 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NMUP48645 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NMUP48645 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NMUP48645 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NMUP48645 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NMUP48645 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms