Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPZBP47756 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms