Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRB3P28472 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms