Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HTR2AP28223 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms