Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms