Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMA1P25786 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA1P25786 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA1P25786 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA1P25786 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA1P25786 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA1P25786 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA1P25786 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMA1P25786 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms