Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PVALBP20472 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PVALBP20472 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PVALBP20472 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PVALBP20472 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PVALBP20472 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PVALBP20472 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PVALBP20472 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms