Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms