Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BMP3P12645 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BMP3P12645 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BMP3P12645 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BMP3P12645 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BMP3P12645 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms