Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT3P12035 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT3P12035 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT3P12035 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT3P12035 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms