Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAVP06756 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAVP06756 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms