Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATG12O94817 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms