Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MEIS3P1A6NDR6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MEIS3P1A6NDR6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms