Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A087WWV3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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