Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF215Q9Y6U7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF215Q9Y6U7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF215Q9Y6U7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF215Q9Y6U7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF215Q9Y6U7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms