Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRT4Q9Y6E7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRT4Q9Y6E7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRT4Q9Y6E7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRT4Q9Y6E7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms