Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF6Q9Y4K3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF6Q9Y4K3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF6Q9Y4K3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF6Q9Y4K3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.8 ms