Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms