Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NFE2L3Q9Y4A8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NFE2L3Q9Y4A8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFE2L3Q9Y4A8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms