Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZDHHC9Q9Y397 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ZDHHC9Q9Y397 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZDHHC9Q9Y397 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZDHHC9Q9Y397 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZDHHC9Q9Y397 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZDHHC9Q9Y397 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms