Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39Q9Y376 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39Q9Y376 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAB39Q9Y376 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAB39Q9Y376 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms