Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y316

MEMO1, Protein MEMO1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEMO1Q9Y316 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEMO1Q9Y316 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEMO1Q9Y316 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MEMO1Q9Y316 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEMO1Q9Y316 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEMO1Q9Y316 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms