Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF13Q9Y2Y9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF13Q9Y2Y9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF13Q9Y2Y9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF13Q9Y2Y9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms