Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED16Q9Y2X0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED16Q9Y2X0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED16Q9Y2X0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED16Q9Y2X0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MED16Q9Y2X0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms