Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIK3Q9Y2K2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SIK3Q9Y2K2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIK3Q9Y2K2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SIK3Q9Y2K2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIK3Q9Y2K2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SIK3Q9Y2K2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms