Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOBEC2Q9Y235 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC2Q9Y235 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOBEC2Q9Y235 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC2Q9Y235 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC2Q9Y235 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms